Papaijasiemenöljy sisältää tyydyttymättömiä rasvahappoja. Niistä on huomionarvoisia seuraavat: öljy-, palmitiini- ja steariinihapot. Lisäksi se sisältää myös ravitsemuksellisia vitamiineja E, C ja B. Lisäksi se sisältää magnesiumia ja kaliumia.
Papaijasiemenöljy sisältää myös lykopeeni joka suojaa ultraviolettisäteilyltä. Se sisältää myös papaiini eli entsyymi, jota käytetään epidermiksen kuorintaan.